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Subcortical brain structures are integral to motion, consciousness, emotions and learning. We identified common genetic variation related to the volumes of the nucleus accumbens, amygdala, brainstem, caudate nucleus, globus pallidus, putamen and thalamus, using genome-wide association analyses in almost 40,000 individuals from CHARGE, ENIGMA and UK Biobank. We show that variability in subcortical volumes is heritable, and identify 48 significantly associated loci (40 novel at the time of analysis). Annotation of these loci by utilizing gene expression, methylation and neuropathological data identified 199 genes putatively implicated in neurodevelopment, synaptic signaling, axonal transport, apoptosis, inflammation/infection and susceptibility to neurological disorders. This set of genes is significantly enriched for Drosophila orthologs associated with neurodevelopmental phenotypes, suggesting evolutionarily conserved mechanisms. Our findings uncover novel biology and potential drug targets underlying brain development and disease.
Genetic architecture of subcortical brain structures in 38,851 individuals
Satizabal C. L.;Adams H. H. H.;Hibar D. P.;White C. C.;Knol M. J.;Stein J. L.;Scholz M.;Sargurupremraj M.;Jahanshad N.;Roshchupkin G. V.;Smith A. V.;Bis J. C.;Jian X.;Luciano M.;Hofer E.;Teumer A.;van der Lee S. J.;Yang J.;Yanek L. R.;Lee T. V.;Li S.;Hu Y.;Koh J. Y.;Eicher J. D.;Desrivieres S.;Arias-Vasquez A.;Chauhan G.;Athanasiu L.;Renteria M. E.;Kim S.;Hoehn D.;Armstrong N. J.;Chen Q.;Holmes A. J.;den Braber A.;Kloszewska I.;Andersson M.;Espeseth T.;Grimm O.;Abramovic L.;Alhusaini S.;Milaneschi Y.;Papmeyer M.;Axelsson T.;Ehrlich S.;Roiz-Santianez R.;Kraemer B.;Haberg A. K.;Jones H. J.;Pike G. B.;Stein D. J.;Stevens A.;Bralten J.;Vernooij M. W.;Harris T. B.;Filippi I.;Witte A. V.;Guadalupe T.;Wittfeld K.;Mosley T. H.;Becker J. T.;Doan N. T.;Hagenaars S. P.;Saba Y.;Cuellar-Partida G.;Amin N.;Hilal S.;Nho K.;Mirza-Schreiber N.;Arfanakis K.;Becker D. M.;Ames D.;Goldman A. L.;Lee P. H.;Boomsma D. I.;Lovestone S.;Giddaluru S.;Le Hellard S.;Mattheisen M.;Bohlken M. M.;Kasperaviciute D.;Schmaal L.;Lawrie S. M.;Agartz I.;Walton E.;Tordesillas-Gutierrez D.;Davies G. E.;Shin J.;Ipser J. C.;Vinke L. N.;Hoogman M.;Jia T.;Burkhardt R.;Klein M.;Crivello F.;Janowitz D.;Carmichael O.;Haukvik U. K.;Aribisala B. S.;Schmidt H.;Strike L. T.;Cheng C. -Y.;Risacher S. L.;Putz B.;Fleischman D. A.;Assareh A. A.;Mattay V. S.;Buckner R. L.;Mecocci P.;Dale A. M.;Cichon S.;Boks M. P.;Matarin M.;Penninx B. W. J. H.;Calhoun V. D.;Chakravarty M. M.;Marquand A. F.;Macare C.;Kharabian Masouleh S.;Oosterlaan J.;Amouyel P.;Hegenscheid K.;Rotter J. I.;Schork A. J.;Liewald D. C. M.;de Zubicaray G. I.;Wong T. Y.;Shen L.;Samann P. G.;Brodaty H.;Roffman J. L.;de Geus E. J. C.;Tsolaki M.;Erk S.;van Eijk K. R.;Cavalleri G. L.;van der Wee N. J. A.;McIntosh A. M.;Gollub R. L.;Bulayeva K. B.;Bernard M.;Richards J. S.;Himali J. J.;Loeffler M.;Rommelse N.;Hoffmann W.;Westlye L. T.;Valdes Hernandez M. C.;Hansell N. K.;van Erp T. G. M.;Wolf C.;Kwok J. B. J.;Vellas B.;Heinz A.;Olde Loohuis L. M.;Delanty N.;Ho B. -C.;Ching C. R. K.;Shumskaya E.;Singh B.;Hofman A.;van der Meer D.;Homuth G.;Psaty B. M.;Bastin M. E.;Montgomery G. W.;Foroud T. M.;Reppermund S.;Hottenga J. -J.;Simmons A.;Meyer-Lindenberg A.;Cahn W.;Whelan C. D.;van Donkelaar M. M. J.;Yang Q.;Hosten N.;Green R. C.;Thalamuthu A.;Mohnke S.;Hulshoff Pol H. E.;Lin H.;Jack C. R.;Schofield P. R.;Muhleisen T. W.;Maillard P.;Potkin S. G.;Wen W.;Fletcher E.;Toga A. W.;Gruber O.;Huentelman M.;Davey Smith G.;Launer L. J.;Nyberg L.;Jonsson E. G.;Crespo-Facorro B.;Koen N.;Greve D. N.;Uitterlinden A. G.;Weinberger D. R.;Steen V. M.;Fedko I. O.;Groenewold N. A.;Niessen W. J.;Toro R.;Tzourio C.;Longstreth W. T.;Ikram M. K.;Smoller J. W.;van Tol M. -J.;Sussmann J. E.;Paus T.;Lemaitre H.;Schroeter M. L.;Mazoyer B.;Andreassen O. A.;Holsboer F.;Depondt C.;Veltman D. J.;Turner J. A.;Pausova Z.;Schumann G.;van Rooij D.;Djurovic S.;Deary I. J.;McMahon K. L.;Muller-Myhsok B.;Brouwer R. M.;Soininen H.;Pandolfo M.;Wassink T. H.;Cheung J. W.;Wolfers T.;Martinot J. -L.;Zwiers M. P.;Nauck M.;Melle I.;Martin N. G.;Kanai R.;Westman E.;Kahn R. S.;Sisodiya S. M.;White T.;Saremi A.;van Bokhoven H.;Brunner H. G.;Volzke H.;Wright M. J.;van 't Ent D.;Nothen M. M.;Ophoff R. A.;Buitelaar J. K.;Fernandez G.;Sachdev P. S.;Rietschel M.;van Haren N. E. M.;Fisher S. E.;Beiser A. S.;Francks C.;Saykin A. J.;Mather K. A.;Romanczuk-Seiferth N.;Hartman C. A.;DeStefano A. L.;Heslenfeld D. J.;Weiner M. W.;Walter H.;Hoekstra P. J.;Nyquist P. A.;Franke B.;Bennett D. A.;Grabe H. J.;Johnson A. D.;Chen C.;van Duijn C. M.;Lopez O. L.;Fornage M.;Wardlaw J. M.;Schmidt R.;DeCarli C.;De Jager P. L.;Villringer A.;Debette S.;Gudnason V.;Medland S. E.;Shulman J. M.;Thompson P. M.;Seshadri S.;Ikram M. A.
2019
Abstract
Subcortical brain structures are integral to motion, consciousness, emotions and learning. We identified common genetic variation related to the volumes of the nucleus accumbens, amygdala, brainstem, caudate nucleus, globus pallidus, putamen and thalamus, using genome-wide association analyses in almost 40,000 individuals from CHARGE, ENIGMA and UK Biobank. We show that variability in subcortical volumes is heritable, and identify 48 significantly associated loci (40 novel at the time of analysis). Annotation of these loci by utilizing gene expression, methylation and neuropathological data identified 199 genes putatively implicated in neurodevelopment, synaptic signaling, axonal transport, apoptosis, inflammation/infection and susceptibility to neurological disorders. This set of genes is significantly enriched for Drosophila orthologs associated with neurodevelopmental phenotypes, suggesting evolutionarily conserved mechanisms. Our findings uncover novel biology and potential drug targets underlying brain development and disease.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
