In questo lavoro viene valutata la possibilità dell’impiego di una lipasi 1,3-regiospecifica, quale quella da pancreas suino (LPS), nell’analisi stereospecifica di classi di diacilgliceroli (DAG); in particolare i substrati per la reazione enzimatica sono rappresentati da derivati naftiluretanici della classe sn-1,2-DAG, ottenuti allo scopo di separare le tre classi isomere, sn-1,2-DAG, sn-2,3-DAG e sn-1,3-DAG, per via NP-HPLC. A tal fine è stato pianificato uno studio di molecular modeling per valutare la capacità dei substrati di “accomodarsi” nella cavità catalitica per subire l’azione idrolitica e l’eventuale grado di stereospecificità. Lo studio ha previsto la modellizzazione tridimensionale del derivato uretanico in esame e la successiva analisi di docking del modo di legame al sito catalitico. I modelli ottenuti per il derivato uretanico sono stati inoltre confrontati con quelli individuati per il substrato naturale trioleina.

Approcci di molecular modeling nella valutazione della attività della lipasi pancreatica di suino 1,3-regiospecifica su substrati di derivati feniluretanici di diacilgliceroli

COSSIGNANI, Lina;SIMONETTI, Maria Stella;BLASI, FRANCESCA;DAMIANI, Pietro
2003

Abstract

In questo lavoro viene valutata la possibilità dell’impiego di una lipasi 1,3-regiospecifica, quale quella da pancreas suino (LPS), nell’analisi stereospecifica di classi di diacilgliceroli (DAG); in particolare i substrati per la reazione enzimatica sono rappresentati da derivati naftiluretanici della classe sn-1,2-DAG, ottenuti allo scopo di separare le tre classi isomere, sn-1,2-DAG, sn-2,3-DAG e sn-1,3-DAG, per via NP-HPLC. A tal fine è stato pianificato uno studio di molecular modeling per valutare la capacità dei substrati di “accomodarsi” nella cavità catalitica per subire l’azione idrolitica e l’eventuale grado di stereospecificità. Lo studio ha previsto la modellizzazione tridimensionale del derivato uretanico in esame e la successiva analisi di docking del modo di legame al sito catalitico. I modelli ottenuti per il derivato uretanico sono stati inoltre confrontati con quelli individuati per il substrato naturale trioleina.
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